Depuis 2002, les Régions sont les autorités compétentes pour les transports collectifs régionaux.
Autorité organisatrice, la Région définit l’offre de transport :
- la desserte (fréquence des trains, horaires, arrêts en gare),
- la tarification régionale,
- les objectifs de qualité du service dans les gares et dans les trains,
- apporte la contribution d’équilibre d’exploitation de ces services publics,
- finance les investissements de matériel, d’infrastructures et de pôles d’échanges.